南沙国际物流园区主要沿广州港南沙港区深水码头直接作业区外围设置，是为南沙港区配套的后方物流服务用地，规划面积约65平方公里，周边有南沙港快速、虎门高速、京珠东线等高快速路。广州港南沙港区是广东省发展现化港口物流业的重要基地，是南沙地区基础产业发展的重要配套工程，为临港工业提供大型专业码头配套服务。目前广州港南沙港区已建成10个5-10万吨深水码头，最终将建成华南地区最具有规模的枢纽港之一，为珠江三角洲两岸特别是珠江西岸地区的货物进出提供服务。2007年，全区港口货物吞吐量达7703万吨，增长56%；集装箱吞吐量达455万标箱，增长80%；已开通了至美洲、欧洲、日本、澳洲、东南亚等国际、国内航线近30条。

目前，南沙正积极推进龙穴岛保税物流园区、非保税物流园区和江海联运园区的建设，引进仓储、码头服务等物流项目，尤其是适合南沙港口发展的大宗原材料运输、能带来增值效应的特色物流项目，发展物流、仓储、配送、保税加工、运输、装卸、代理、进出口等物流业务，发展远洋集装箱运输、内陆国际集装箱运输和第三、四方物流服务业，形成立足珠三角、面向全世界的现代化物流产业基地。