1、出口加工区重点发展出口型电子电器产业

广东南沙出口加工区位于广州南沙经济技术开发区万顷沙镇十涌至十一涌，规划面积1.36平方公里。出口加工区采用封闭卡口管理,实行“境内关外”政策，面向国际市场，是目前我国政策最优惠、通关最便捷、设施最完善、管理最规范的特殊监管区域。区内企业可同时享受国家级经济技术开发区和国家出口加工区的各项税收优惠政策。目前面向IT、光电、精密机械、家电等产业开展招商。

2、高新技术产业园区重点发展研发、平面显示、生物制药等高科技产业

南沙高新技术产业基地位于南沙岛的南部和西部，规划占地面积5平方公里，包括南沙资讯科技园、科技产业园等功能区。未来将以南沙资讯科技园为重点，发展软件、光电子、集成电路、新材料、生物医药、创意产业等高新技术产业和新兴行业，带动南沙产业发展和升级，最终发展成为以电子信息产业为重点的高新技术产业基地。目前，中国科学院广州工业技术研究院、北京-香港科大联合研究中心、香港科技大学霍英东研究院、香港科技大学微电子封装院、香港科技大学嵌入式系统设计院、广州南沙慧视通讯科技有限公司、九广铁路公司等多个科研机构和高新技术企业均已在此落户。

3、国际汽车产业园B区重点发展丰田汽车二、三级配套企业

2006年广州市生产轿车62万辆，位居全国第二位。已形成集汽车研发、整车制造、零配件生产、汽车贸易、汽车人才市场和汽车学院等和谐发展的汽车产业链。预计到2010年，广州汽车整车生产能力达到160万辆，产值3000亿元左右，汽车零部件产值将达到800－1000亿元。

随着丰田发动机、整车项目落户南沙，南沙汽车产业聚集效应迅速呈现。与丰田整车基地为邻的国际汽车产业园A区已有26家丰田一级配套企业落户。一批专门为南沙汽车产业服务的培训、营销、维修、物料供应、物流等服务机构陆续进驻南沙。

南沙国际汽车产业园B区位于南沙开发区的中部，距丰田基地18公里、距离广州港南沙港区15公里，紧临南沙港快速路，半小时车程可直达广州市区。B区是高标准建设的国际化产业园区，在B区投资的企业可享用完善的基础配套，同时可与日系汽车共享部分优质供应商，增加零部件的本地采购率，降低生产成本。入园企业可以自行买地建厂，也可以采用租赁厂房的方式投资建厂，园区发展公司将为入园企业提供宿舍、食堂、文化娱乐等配套设施，并负责园区的治安、绿化、保洁、道路及照明设施的维护管理等工作。

4、龙穴岛物流园区重点发展为广州港南沙港区配套的具备比较优势的特色物流产业

南沙国际物流园区具有珠三角几何中心的地理优势，又有广阔的市场辐射力，将成为联结珠江三角洲的交通枢纽和通往港澳及世界各地的黄金水道。龙穴岛综合性物流基地以发展远洋集疏运为主，用地规模约为30～35平方公里，主要划分成江海联运泊位区、港口陆域和水域区、物流园区等三大功能区，发展与港口物流相关的仓储服务、保税加工、物流配送、商业贸易等。

南沙国际物流园区的主体工程是广州南沙保税物流中心（B型），规划面积2.62平方公里。物流园区可通过海关监管的园区与港区间的直通道，使广州港南沙港区一期码头和广州南沙保税物流中心（B型）之间实现“无缝对接”，在南沙港区、物流园区之间实现联动。目前，伯灵顿、马士基等国际著名物流公司陆续进驻，保税物流中心正面向全球物流企业开展招商。

5、三民岛石化园区重点发展为中科炼化一体化项目配套的石化深加工项目

南沙石化工业基地位于南部的万顷沙镇，包括炼化项目用地和三民岛石化中下游产业用地，规划占地面积约40平方公里。按生态石化产业园的标准，贯彻“五个一体化”（即产品项目一体化、公用辅助一体化、物流传输一体化、环境保护一体化、管理服务一体化）的理念规划石化产业，全力打造世界一流石化产业基地。中石化与科威特国家石油公司合资年产量1200万吨炼油、100万吨乙烯的炼化一体化项目已经落户南沙。三民岛石化深加工基地依托中科炼化一体化项目，综合利用乙烯等基本有机化工原料，以市场为导向，发展与区域优势产业相关的合成材料和精细化工项目。